Природные условия
Лекарственные растения Иссык-Кульской области: Иссык-Кульский корень, алтей, белена чёрная, гармала обыкновенная, горец перечный, горец почечуйный, донник лекарственный, душица обыкновенная, зверобой, облепиха крушиновидная, мать и мачеха, подорожник ланцетный, горная смородина, шиповник, эфедра, тимьян зеравшанский, облепиха и др.
В пределах области встречаются 11 видов высших цветковых растений занесённых в Красную книгу республики. В котловине это - аир, ирный корень, чесниэлня волосистая, тюльпан Колпаковского. сибирячка тяньшаньская, девясил высокий; в пределах сыртовых нагорий - соссюрея обернутая, барбарис кашгарский, тяньшаньская зонтиконосная, копеечник киргизский, ветреница туполопастная. Растительность котловины подвержен мощному, с годами увеличивающемуся антропогенному прессу, уменьшению. На территории области находятся 2 ботанических заказника - «Байдамтал» и «Тюпский» и 1 лесной «Кичи». Общая площадь естественных пастбищ области 1 млн. 371 тыс.га, в том числе 606 тыс.га летних, 403 тыс.га весенне-осенних и 362 тыс.га зимних. Горные ущелья, покрытые тяньшаньской елью, эндемичная растительность, лекарственные растения создают красивую природу и являются одним из самых важных критериев, привлекает туристов. Животный мир области включает 50 видов млекопитающих, 11 - пресмыкающихся. 285 - птиц. 4 -земноводных, 31 - рыб, около 10 видов беспозвоночных и около 10 видов позвоночных - эндемиков Тяньшаня. Большинство рыб относятся к эндемикам Ыссыккуля. Фауна в целом сравнительно молодая, сложилась в современном виде в четвертичном периоде. Бассейн озера Ыссыккуль образует Ыссыккульский зоогеографический округ, состоящий из озёрного, предгорного и среднегорного участков. Озёрный участок включает береговые и водные сообщества. Встречаются около 100 видов водоплавающих и околоводных птиц. Из них гнездятся гагара, поганка, волчок, чёрный аист, нырок, обыкновенная чайка, чайконосая крачка. Большое число видов обитает здесь, зимует, а некоторые птицы улетают в другие края. Это серые цапли, лебеди (кликун и шипун), серый гусь, чайки (серебристая, сизая, хохотун) и другие. Ыссыккуль - крупнейшее незамерзающее озеро Центральной Азии - является местом зимовки водоплавающих и околоводных птиц международного значения. В их число входят нырок, лысуха, почанка, кряква, лебеди, серые гуси, казарки, крохали. В озере обитают 11 аборигенных рыб - пескарь, гольян, голый осман, маринка, чебак, чебачок, губач, сазан, тяньшаньский голец и 10 акклиматизированных. Ыссыккульская форель, радушная форель, сиговые, судак, линь, лещ и др. Сазан, форель, судак, чебак и чебачок являются объектами любительского лова.
Среднегорный участок населяют сообщества горных степей, субальпийских лугов, скал, кустарников, лесов и рек. Здесь обитают 32 вида млекопитающих: землеройки, заяц-толай, белка, серый сурок, лесная мыть, серый хомячок, волк, лисица, медведь, барсук, рысь, кабан, косуля, марал. Из 152 видов птиц характерны лесные: корицы, перепелятник, канюк, чеглок, тетерев, кеклик, вяхирь, ушастая сова, дрозды, синицы и др.
Высокогорные участки занимают большую часть территории и отличаются сравнительной однородностью. Из млекопитающих характерны: толай, барс, большеухая пищуха, серый сурок, тушканчик прыгун, слепушонка, медведь, волк, горностай, манул, горный козёл, тяньшаньский баран. Из птиц: огарь, бородач, чёрный гриф, белоголовый сип, кумай, улар, скальный голубь, скальная ласточка. Охотничье-промысловое значение в высокогорье могут иметь горный козёл, заяц, горностай, ласка, серый сурок, волк, лисица, памирский подвид архара (т.н.баран Марко Поло), кекелик, улар, голуби - сизый и скальный.
Для соблюдения равновесия в экосистеме и сохранения численности популяции в Ыссыккульской области созданы разного рода заповедники, заказники и егерские участки, которые играют большую роль в развитии туризма, в частности экотуризма. Природа Сарычатээрташского заповедника одна из особо уникальных территорий Ыссыккульской области. Заповедник расположен в долине между Тескей Алатоо и хребта Акшыйрак. Площадь - 72 тыс.га. Через долину протекает река Сарычат и вместе с крутыми склонами создаёт вид ущелья. Заповедник был организован специальным постановлением Правительства КР 10 марта 1995 года № 76. Цель заповедника - организация охраны экосистем высокогорных сыртов Центрального Тяньшаня. На территории заповедника обитают архары, илбирсы. лисицы, волки, суслики и т.д. Из птиц -улары, беркуты, кекилики. сороки, горные леи.